Namen mikroinkapsulacije navadno določa prepustnost membrane, ki jo skrbno izberemo, da ustreza različnim sistemom in zahtevam.
Membrana s počasnim sproščanjem
Jedro se iz kapsule sprošča skozi daljše obdobje. Čas sproščanja je odvisen od vrste membrane, njene debeline in drugih lastnosti ter lahko traja od nekaj dni do več mesecev. Učinkovine so lahko topne v vodi ali topilih. Takšne membrane se med drugim uporabljajo v dišavah, pesticidih, eteričnih oljih, kanabinoidih in reaktivnih kemikalijah.
Neprepustna membrana
Jedrni material je v kapsulah in popolnoma ločen ter zaščiten pred okoljskimi vplivi. Namen tovrstne inkapsulacije je zagotavljanje popolne ločenosti od okolja. Ta rešitev je posebno koristna za fazno spremenljive snovi (PCM), ki jih je mogoče uporabiti v tekstilni in gradbeni industriji.
Pametna membrana
Jedro se sprosti v določenih okoliščinah (kot so mehanska sila, osmotski tlak, povišanje temperature …). Primeri takšne uporabe so mikroinkapsulirana dišava, ki deluje na principu “podrgni in povonjaj”, sprostitev učinkovine v primeru poškodbe membranske ovojnice (npr. samoobnovljivi premazi) ali sprostitev učinkovine šele po nanosu sistema (npr. premaza).